Składniki haloenzymowe: (1) Core Enzyme And (2) The Sigma Factor

Kompletna polimeraza RNA E. coli jest znana jako holoenzym. Holoenzym składa się z następujących dwóch składników: (1) podstawowy enzym i (2) czynnik sigma. Holoenzym może być symbolizowany jako α ₂ β β 'σ. !

1. Core Enzyme:

Rdzeniowy enzym nie może zainicjować transkrypcji we właściwych miejscach, ale może syntetyzować RNA przy użyciu DNA jako matrycy.

Rdzeniowa polimeraza RNA składa się z czterech polipeptydów, które są z następujących trzech typów:

(a) Podjednostka α:

Jest obecny w dwóch kopiach / rdzeniu cząsteczki enzymu i dotyczy wiązania z DNA promotora. Dokładny mechanizm jego wiązania z DNA nie jest znany.

(b) Podjednostka β:

Jest obecny w cząsteczce pojedynczej kopii / enzymu i uczestniczy w wiązaniu z nadchodzącymi nukleotydami do syntezy RNA. Rozpoznanie prawidłowych nukleotydów przeciwnych podstawom DNA wydaje się być oparte na ich ogólnej geometrii w stosunku do siebie nawzajem, raczej na zachowaniu par zasad.

(c) Podjednostka β ':

Bierze udział w wiązaniu z matrycowym DNA, tj. Tworzy jednoniciowy odcinek DNA, aby umożliwić transkrypcję.

Każda podjednostka przyczynia się do funkcji enzymu rdzeniowego jako całości, która powinna mieć co najmniej następujące cztery odrębne miejsca funkcjonalne.

(i) Miejsce odwijania DNA, które odwija ​​dupleks DNA jako rdzeń enzymu, przesuwa się o jedną zasadę po transkrypcji DNA.

(ii) Miejsce wiążące się z "nicią antysensowną", nić, która jest transkrybowana.

(iii) Inne miejsce wiąże się z "nicią sensową", z nicią komplementarną z "nicią antysensowną" DNA transkrybowanego.

(iv) Miejsce przewijania DNA dotyczy przewinięcia dwóch nici DNA do normalnego dupleksu.

2. Czynnik Sigma:

Czynnik sigma bierze udział w stabilnym wiązaniu polimerazy RNA z DNA promotora; i ewentualnie z inicjacją transkrypcji. Nie bierze udziału w transkrypcji jako takiej (tj. Syntezie RNA), gdy jest uwalniany, gdy łańcuch RNA osiąga 8-9 zasad; rdzeń enzymu następnie kontynuuje transkrypcję.

Polimeraza RNA w eukariotach:

Wszystkie eukarioty posiadają trzy różne klasy polimerazy RNA, zwane polimerazą I, polimerazy RNA II i polimerazy RNA III.

Polimeraza RNA I:

Enzym ten znajduje się w jąderku i jest odpowiedzialny za transkrypcję rybosomalnego RNA.

Polimeraza RNA II:

Ta polimeraza znajduje się w nukleoplazmie, który jest częścią jądra innego niż jąderka. Enzym ten jest głównym składnikiem aktywności polimerazy RNA i transkrybuje wszystkie geny wytwarzające mRNA. W eukariotach transkrypt jest początkowo w postaci prekursorów mRNA, zwanych heterogennym jądrowym RNA (hn RNA), które są następnie przetwarzane w mRNA.

Polimeraza RNA III:

Enzym ten występuje w nukleoplazmie i transkrybuje geny RNA tRNA i 5S.

Organelarna polimeraza RNA:

Oprócz jądrowych polimerazy RNA I, II i III, komórki eukariotyczne mają niewielką aktywność polimerazy RNA w ich organellach, tj. Mitochondriach i plastydach. Te polimerazy są potrzebne do transkrypcji stosunkowo niewielu genów obecnych w tych organellach. Enzymy te wydają się być analogiczne do polimerazy RNA fagowego.